Yayasan Kanisius berdiri sejak tahun 1918, dengan kantor pusat berkedudukan di kota Semarang. Mempunyai 4 kantor Cabang / perwakilan, yakni Cabang Yogyakarta, Cabang Magelang, Cabang Surakarta, dan Cabang Semarang. Yayasan Kanisius memiliki 176 Sekolah mulau dari jenjang TK, SD, SMP sampai SMA / SMK.